La investigación, al establecerse como un proceso misional en Unicomfacauca, apunta a la generación y sostenimiento de una Cultura Investigativa que integre tanto el aspecto formativo, esto es, la actividad académica y práctica que propende por capacitar y formar a los estudiantes en este campo, como la investigación formal y la divulgación científica, a partir del fortalecimiento del talento humano en investigación, la generación y transmisión del conocimiento científico y las alianzas con Universidades y Centros de Investigación a nivel nacional e internacional.